Διάκριση iGEM IOANNINΑ 2024 – Ο ρόλος της Πληροφορικής
- Ανάρτηση από: admincs
- αναρτήθηκε σε: Διακρίσεις, Γενικά
Η ομάδα iGEM IOANNINA είναι μία φοιτητική ομάδα του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων, η οποία συνίσταται κάθε χρόνο με στόχο να συμμετάσχει στον παγκόσμιο διαγωνισμό Συνθετικής Βιολογίας iGEM στο Παρίσι.
Καθώς η επιστήμη της Βιολογίας έχει εκσυγχρονιστεί πλήρως με τα δεδομένα της εποχής μας, η κάθε ομάδα iGEM δεν μπορεί να περιοριστεί αποκλειστικά στον τομέα της Βιολογίας: σε αυτή την διεπιστημονική προσπάθεια καίριο ρόλο παίζει η πληροφορική. Με την χρήση λογισμικού μια ομάδα μπορεί να μοντελοποιήσει μαθηματικά το σύστημα της, να τρέξει προσομοιώσεις και να αναλύσει πειραματικά δεδομένα. Σε συγκεκριμένες περιπτώσεις μία ομάδα μπορεί να χρειαστεί να αναπτύξει υλικό, όπως μια ηλεκτρονική συσκευή, για κάποιο πρακτικό σκοπό της εργασίας της. Ακόμη βασική προϋπόθεση για την συμμετοχή στον διαγωνισμό είναι η ανάπτυξη μιας ιστοσελίδας (wiki) όπου παρουσιάζονται διεξοδικά όλες οι λεπτομέρειες του πρότζεκτ. Η πληροφορική λοιπόν παίζει και τον ρόλο της τεκμηρίωσης και δημοσιοποίησης του πρότζεκτ. Τις παραπάνω αρμοδιότητες αναλαμβάνει το τμήμα του Dry Lab.
Επικεφαλής του Dry Lab στην φετινή ομάδα ήταν ο Ρίζος Ιωάννης, Υποψήφιος Διδάκτωρ στο Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορικής. Η συνεισφορά του στην ομάδα αποτελεί η χρήση ενός υπάρχοντος μοντέλου μηχανικής μάθησης Random Forest για την παραγωγή guide–RNAs για τον Ιό του Δυτικού Νείλου. Τα guide–RNAs αποτελούν ένα από τα σημαντικότερα κομμάτια της τεχνολογίας γονιδιακής επεξεργασίας CRISPR–Cas 13 και παράγονται από δεδομένα του RNA του ιού. Μετά από την ανάλυση φυσικών χαρακτηριστικών του RNA, η οποία γίνεται με διάφορα λογισμικά προσομοίωσης, το μοντέλο Random Forest χρησιμοποιεί αυτά τα χαρακτηριστικά για να προβλέψει την ποιότητα των guide–RNAs και να προτείνει τα καλύτερα. Τέλος σχεδίασε το wiki του πρότζεκτ, όπου μπορείτε να διαβάσετε περισσότερα γι’ αυτό (https://2024.igem.wiki/ioannina/).
Στα πλαίσια του διαγωνισμού αυτού η ομάδα του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων καλείται να οργανώσει και να εκπονήσει ένα καινοτόμο ερευνητικό έργο γύρω από την επιστήμη της Βιολογίας. Παράλληλα, επιδιώκεται η επικοινωνία της επιστήμης και του διαγωνισμού στο ευρύ κοινό, οργανώνοντας και συμμετέχοντας σε πλήθος δράσεων και εκδηλώσεων. Επιπλέον, στόχος είναι η διασύνδεση του Πανεπιστημίου με την ευρύτερη κοινωνία, τους φορείς επιχειρηματικότητας και τις δομές περιφερειακής διοίκησης.
Φέτος η iGEM IOANNINA παρουσίασε το πρότζεκτ της “ATROPOS”, που στοχεύει στην αντιμετώπιση της εγκεφαλίτιδας που προκαλείται από τον Ιό του Δυτικού Νείλου. Αυτό το έργο προσφέρει μια πρωτοποριακή αντιική θεραπεία, αξιοποιώντας την τελευταία λέξη της τεχνολογίας γονιδιακής επεξεργασίας CRISPR–Cas 13, για να αντιμετωπίσει έναν αυξανόμενο κίνδυνο για τη χώρα μας. Οι περιβαλλοντικές αλλαγές που προκαλεί η κλιματική αλλαγή ευνοούν την εξάπλωση ιών οι οποίοι μέχρι πρόσφατα δεν επηρέαζαν τόσο την Ελλάδα, όπως ο ιός του Δυτικού Νείλου.
Γι’ αυτό το έργο η ομάδα κέρδισε χρυσό μετάλλιο, το οποίο συμβολίζει την Αριστεία στη Συνθετική Βιολογία, καθώς και κατάφερε να προκριθεί ως υποψήφια για τρία βραβεία ειδικής κατηγορίας. Συγκεκριμένα, ήταν υποψήφια για το βραβείο καλύτερου έργου στην κατηγορία των Λοιμωδών Νοσημάτων (Best Infectious Diseases Project), συναγωνιζόμενη ομάδες από το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης και του Σικάγο. Επιπλέον, αναδείχθηκε ως η 2η καλύτερη ομάδα στη μεταπτυχιακή κατηγορία για το βραβείο καλύτερης Συμπεριληπτικότητας (Best Inclusivity) και ήταν υποψήφια για το βραβείο καλύτερης Εκπαίδευσης (Best Education), διακρινόμενη διεθνώς για τις δραστηριότητες επιστημονικής επικοινωνίας που διοργάνωσε.
Για περισσότερες πληροφορίες για την ομάδα και τη δράση της μπορείτε να επισκεφτείτε την ιστοσελίδα (https://igemioannina.unit.uoi.gr/ ) και τα social media της.
Instagram: https://www.instagram.com/igemioannina/
Facebook: https://www.facebook.com/igemioannina
YouTube: https://www.youtube.com/@igemioannina5414?app=desktop